İstanbul - Ankara seferini yapan Yakup Kadri Karaosmanoğlu adlı hızlandırılmış tren, Sakarya'nın Pamukova İlçesi yakınlarında Mekece Köyü mevkiinde raydan çıkarak devrildi. Kazada 36 kişi yaşamını yitirdi, 74 kişi yaralandı.
11 Ağustos 2004
İstanbul - Adapazarı seferini yapan Adapazarı Ekspresi ve Ankara - İstanbul seferini yapan Başkent Ekspresi,Kocaeli'nin Gebze ilçesinin Tavşancıl mevkiinde saat 16:51'de kafa kafaya çarpıştı. Kazada 8 kişi öldü, 88 kişi yaralandı.
27 Ocak 2008
İstanbul-Denizli seferini yapan Pamukkale Ekspresi Çöğürler-Değirmenözü (Kütahya) istasyonları arasında seyrederken raydan çıktı. Kaza sonucunda 9 kişi yaşamını yitirdi, 37 kişi yaralandı.