Silivri Cezaevi'nde 2011 yılında hayatını kaybeden eski MİT görevlisi Kaşif Kozinoğlu'nun ölümüne ilişkin yürütülen soruşturmada, "Kurtlar Vadisi" dizisinin senaristlerinden Raci Şaşmaz'ın savcılık ifadesi ortaya çıktı. Şaşmaz, "Kaşifoğlu karakteri istihbarat içi çatışmaları anlatmak için oluşturuldu, hikayesi bittiğinde ise dizide öldürülerek başka konulara geçildi. Bu tamamen dizi kurgusudur. FETÖ'cü Ali Fuat Yılmazer'in senaryoya müdahale ettiğine dair iddialar dolaşıyor ise de bu tamamen iftiradır. Bu açık iftiraya 20 yılda çeşitli kereler cevap verildi, bir kez daha verelim: Legal ya da illegal hiçbir güç ya da suç odağıyla irtibatımız yoktur" dedi. Şaşmaz, ilk yapımcı Osman Sınav'ın diziden çekilmesiyle ilgili de şunları anlattı: "Osman Sınav zaman zaman senaryo konusunda fikir vermek istedi ancak izin vermedim. Bu talebini kabul etmediğim için tehdit aldığını, çocukları olduğunu ve işi devretmek istediğini söyledi." Öte yandan gazeteci Selahattin Günday, soruşturma kapsamında tutuklanmasına yapılan itirazın ardından "suç örgütü kurma" suçlamasıyla ikinci kez tutuklandı.
